जॉन विलियम ड्रेपर द्वारा लिखित “धर्म एवं विज्ञान के बीच संघर्ष का इतिहास” एक 19वीं शताब्दी के अंत में लिखित ऐतिहासिक ग्रंथ है। यह पुस्तक इतिहास भर में धार्मिक विश्वासों एवं वैज्ञानिक चिंतन के बीच चली आ रही संघर्षों पर विस्तार से चर्चा करती है, एवं इस संघर्ष की जड़ें प्राचीन सभ्यताओं एवं आधुनिक विज्ञान के उदय तक जाती हैं। ड्रेपर का मानना है कि इन दो क्षेत्रों के बीच का संघर्ष एक महत्वपूर्ण एवं गंभीर मुद्दा है, जो सामाजिक मानदंडों, शासन प्रणाली एवं ज्ञान-प्राप्ति की प्रक्रिया को प्रभावित करता है। पुस्तक की शुरुआत में ड्रेपर यूरोप एवं अमेरिका के शिक्षित वर्गों की मानसिक स्थिति पर चर्चा करते हैं; ये वर्ग पारंपरिक धार्मिक विश्वासों से दूर जा रहे हैं। वे धार्मिक मतबादों, विशेषकर कैथोलिक चर्च द्वारा प्रतिनिधित्व किए जाने वाले मतबादों, एवं विज्ञान की प्रगति के बीच के ऐतिहासिक तनाव एवं विरोध पर भी विस्तार से चर्चा करते हैं। ड्रेपर इस संघर्ष को केवल ऐतिहासिक मुद्दा ही नहीं, बल्कि वर्तमान समय का भी मुद्दा मानते हैं; उनका कहना है कि समाज में धर्म की भूमिका की समीक्षा वैज्ञानिक प्रगति के संदर्भ में ही की जानी चाहिए। इस प्रकार, ड्रेपर पाठकों को इतिहास में ऐसे महत्वपूर्ण क्षणों की विस्तृत जानकारी देते हैं, जहाँ धर्म एवं विज्ञान आमने-सामने आए; साथ ही इस संघर्ष के मानवता की सत्य एवं अस्तित्व संबंधी समझ पर पड़ने वाले गहरे प्रभावों पर भी चर्चा करते हैं।